Identyfikacja peptydów wiążących się z glównym kompleksem zgodności tkankowej (MHC) jest ważnym krokiem w wyborze kandydatów na epitopy komórek T, które nadają się do wykorzystania w nowych szczepionkach. Rowek wiązania cząsteczki MHC klasy II jest otwarty po obu stronach, co pozwala na dużą zmiennośc dlugości peptydów wiążących się z tą cząsteczką, a w konsekwencji utrudnia przewidywanie motywu rdzenia wiązania. Dokladne i wydajne podejście obliczeniowe do przewidywania takich peptydów może znacznie skrócic czas i obniżyc koszty związane z projektowaniem nowych szczepionek. EpiGASVM, nowe podejście do komputerowego przewidywania epitopów MHC klasy II, zostalo opracowane poprzez polączenie algorytmów genetycznych i maszyn wektorów nośnych. Dziewięc wariantów EpiGASVM zastosowano do dwóch zestawów danych porównawczych o zmniejszonym podobieństwie. Dokladnośc przewidywania i obszar pod krzywą charakterystyki operacyjnej odbiornika zostaly obliczone jako miary wydajności. Technika ta zostala porównana z niektórymi najnowocześniejszymi technikami w tej dziedzinie (np. ARB, SMM-Align, PROPRED, NN-Align). Wyniki pokazują, że EpiGASVM jest obiecującą nową techniką rozwiązywania problemu przewidywania epitopów MHC klasy II.
ThriftBooks sells millions of used books at the lowest everyday prices. We personally assess every book's quality and offer rare, out-of-print treasures. We deliver the joy of reading in recyclable packaging with free standard shipping on US orders over $20. ThriftBooks.com. Read more. Spend less.