Vers Une Modélisation Plus Réaliste Des Systèmes Biologiques [French]

By Fabien Archambault and Archambault-F

La plupart des fonctions energie potentielle utilisees pour simuler les systemes biologiques complexes ne traitent qu'implicitement la polarisation electronique et ce, de facon tres incomplete. Bien qu'efficaces pour un large eventail d'applications, ces champs de force atteignent rapidement leurs limites des lors que les effets de polarisation electronique sont importants. Dans cette these, j'ai developpe une approche basee sur la mecanique quantique pour obtenir des parametres d'un champ de force polarisable ayant pour composantes des charges, des polarisabilites distribuees d'ordre zero et un (isotrope) et un potentiel de van der Waals decrit par une fonction de Buckingham. L'energie d'induction peut etre attenuee par une fonction de Tang et Toennies pour decrire l'energie d'echange-induction. Cette approche a ete effectuee avec succes pour l'interaction d'ions avec l'eau et le benzene mais aussi dans le cas d'un dimere d'eau. Une premiere etude des resultats en dynamique moleculaire montre que les parametres obtenus en phase gazeuse peuvent se transferer pour les simulations en phase condensee."

• Format: Paperback
• Language: French
• ISBN: 6131591962
• ISBN13: 9786131591969
• Release Date: August 2011
• Publisher: Omniscriptum
• Length: 156 Pages
• Weight: 0.52 lbs.
• Dimensions: 0.4" x 6.0" x 9.0"