Les caracteristiques structurales et les interactions intra et/ou intermoleculaires non-covalentes jouent un role primordial dans l'activite des molecules d'interet biologique, notamment lors de la reconnaissance moleculaire entre un medicament et son recepteur. Il est donc interessant de decrire les structures intrinseques de peptides, d'oligonucleotides ou de complexes d'interet pharmaceutiques en phase gazeuse. Pour cela, nous prenons appui sur deux techniques experimentales complementaires, la spectroscopie IRMPD et la spectrometrie de mobilite ionique, dont les resultats sont compares avec des simulations. Dans ce travail de these, j'ai d'abord teste les predictions d'une methode QM/MM en ce qui concerne le calcul des spectres IR d'especes d'interet biologique isolees. J'ai ensuite utilise cette methode pour simuler les spectres IR de brins de la proteine amyloide en phase gazeuse. Je me suis egalement interesse aux changements de structure induits par la complexation d'un antibiotique, la vancomycine, avec un modele de son recepteur."
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