Simulation von Daten aus Kartierungsversuchen durch Sequenzierung [German]

By Fabricio Araujo

J ngste Fortschritte bei den Next-Generation-Sequencing (NGS)-Technologien haben den Zeitaufwand f r die Identifizierung von Mutationen in der Vorw rtsgenetik, einer der wichtigsten Methoden zur Charakterisierung der Genfunktion bei Pflanzen, verringert. Die Methode zur Identifizierung von Mutationen, die durch physikalische oder chemische Mutagene in einer Kartierungspopulation ausgel st wurden, wird als Mapping-by-Sequencing bezeichnet. Unter den verschiedenen Techniken, die diese Methodik anwenden, sticht das Next-Generation-Mapping (NGM) hervor, weil es eine kleine Anzahl von Mutanten in der Kartierungspopulation erfordert. In den ver ffentlichten Arbeiten ist jedoch nicht klar, welche Parameter zur Bildung der Kartierungspopulation (Anzahl der Individuen, Anzahl der Mutanten, Art der Kreuzung) und zur Sequenzierung (verwendete Plattform, Sequenzierungsmethode, Abdeckung) in den Experimenten verwendet wurden. Aus diesem Grund wurde eine Bioinformatik-Pipeline entwickelt, die die Simulation von Daten aus Experimenten mit der NGM-Technik an der Modellpflanze Arabidopsis thaliana erm glicht, einer der am meisten untersuchten und sequenzierten Pflanzen in der Literatur.

• Format: Paperback
• Language: German
• ISBN: 6208635608
• ISBN13: 9786208635602
• Release Date: February 2025
• Publisher: Verlag Unser Wissen
• Length: 52 Pages
• Weight: 0.18 lbs.
• Dimensions: 0.1" x 6.0" x 9.0"