Rilevamento di ortologhi e paraloghi mediante albero filogentico [Italian]

By Sukhdeep Kaur and Manpreet Singh Malhi

L'ortologia e la paralogia sono concetti centrali nella biologia evolutiva. La previsione di ortologhi (geni omologhi che divergono a causa della speciazione) e paraloghi (geni omologhi che divergono a causa della duplicazione) parte integrante di molti metodi di genomica comparativa. Esistono numerosi metodi utilizzati per dedurre l'ortologia e la paralogia. Gli ortologhi e i paraloghi possono essere dedotti utilizzando metodi basati su grafi e filogenetici. Tuttavia, i metodi basati sulle analisi filogenetiche si avvicinano molto alla definizione originale di ortologia e paralogia e sono noti per essere accurati. Nel presente lavoro, stata sviluppata una pipeline per il rilevamento di ortologhi e paraloghi basata sull'approccio filogenetico. Una serie di proteine stata scaricata da UniProt ed stato sviluppato un database. Sono stati individuati ortologhi e paraloghi per la sequenza proteica di query. L'algoritmo di sovrapposizione delle specie e la soglia di distanza patristica a coppie sono stati utilizzati per identificare una previsione accurata e regolare di paraloghi e ortologhi. stata sviluppata un'interfaccia facile da usare.

• Format: Paperback
• Language: Italian
• ISBN: 6208405777
• ISBN13: 9786208405779
• Release Date: December 2024
• Publisher: Edizioni Sapienza
• Length: 56 Pages
• Weight: 0.21 lbs.
• Dimensions: 0.1" x 6.0" x 9.0"