Phe, Tyr i Trp: Badanie konformacyjne form jonowych i dimerycznych [Polish]

By Uppula Purushotham

W pracy przedstawiono doglębną analizę konformacyjną trzech aminokwas w aromatycznych: tryptofanu, fenyloalaniny i tyrozyny, wraz z ich formami jonowymi i zwitterjonowymi, z wykorzystaniem obliczeń opartych na pierwszych zasadach. Dla każdego aminokwasu, obszerne skanowanie powierzchni energii potencjalnej ujawnilo liczne stabilne konformery, w tym ponad 50 unikalnych struktur dimerycznych dla każdego z nich. Stabilizacja tych struktur wynika z bogatej gry oddzialywań niekowalencyjnych, takich jak wiązania wodorowe (zwlaszcza NH-O), π-π stacking, CH-π, NH-π i OH-π. Formy monomeryczne faworyzowaly konformacje z silnym wewnątrzcząsteczkowym wiązaniem wodorowym, podczas gdy formy dimeryczne wykazywaly r wnowagę między wiązaniem wodorowym a oddzialywaniami aromatycznymi. Analiza atom w w cząsteczkach zapewnila dalszy wgląd w silę i naturę tych oddzialywań. Obserwacje por wnawcze ze strukturami Protein Data Bank podkreślily preferencje zależne od geometrii: π-π stacking dominuje w bliskim zasięgu, podczas gdy interakcje CH-π w ksztalcie litery T są bardziej rozpowszechnione na większych odleglościach. Odkrycia te naświetlają skomplikowany niekowalencyjny krajobraz ksztaltujący konformacje aminokwas w w ukladach biologicznych.

• Format: Paperback
• Language: Polish
• ISBN: 6208476844
• ISBN13: 9786208476847
• Release Date: August 2025
• Publisher: Wydawnictwo Nasza Wiedza
• Length: 96 Pages
• Weight: 0.31 lbs.
• Dimensions: 0.2" x 6.0" x 9.0"