Las especies nativas constituyen un alto potencial para la alimentaci?n y salud. Sin embargo, muchas de ellas dejaron de ser utilizadas masivamente desde la ?poca colonial y hoy son escasamente conocidas. Un ejemplo de ello es el tarwi, leguminosa que hoy en d?a empieza a recobrar importancia a nivel mundial debido a su elevado valor nutritivo, rico en prote?nas y aceites en sus semillas (Schoeneberg et al., 1981). Sin embargo, pese a sus extraordinarias caracter?sticas el cultivo de tarwi se ve limitado a ciertas zonas de la regi?n Andina (Jacobsen et al., 2011). Algo similar ocurre con otras especies nativas cultivables. Es por ello que, se han desarrollado programas de fitomejoramiento que hacen uso de la gran variabilidad gen?tica de estas especies para seleccionar y desarrollar nuevas variedades que cuenten con mejores caracter?sticas agron?micas y nutricionales. Para la realizaci?n de esta selecci?n se requiere el conocimiento de la estructura gen?tica y la relaci?n existente entre el material disponible. Este conocimiento se puede obtener haciendo uso del sistema de marcadores moleculares de ADN basados en PCR; siendo uno de los marcadores m?s utilizados los ISSR.
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