Les g nes de virulence des bact ries pathog nes, qui codent pour des toxines, des adh sines, des invasines ou d'autres facteurs de virulence, peuvent tre situ s sur des l ments g n tiques transmissibles tels que des transposons, des plasmides ou des bact riophages. En outre, ces g nes peuvent faire partie de r gions particuli res du chromosome bact rien, appel es lots de pathog nicit (PAI). Les lots de pathog nicit se trouvent aussi bien dans les bact ries Gram-n gatives que dans les bact ries Gram-positives. Elles sont pr sentes dans le g nome des souches pathog nes d'une esp ce donn e, mais absentes ou rarement pr sentes dans celles des variantes non pathog nes de la m me esp ce ou d'esp ces apparent es. Elles comprennent de grandes r gions d'ADN (jusqu' 200 kb d'ADN) et portent souvent plus d'un g ne de virulence, dont la teneur en G+C diff re souvent de celle du reste du g nome bact rien. Dans la plupart des cas, les PAI sont flanqu es de s quences d'ADN sp cifiques, telles que des r p titions directes ou des l ments de s quence d'insertion (IS). En outre, les PAI de certaines bact ries (par exemple Escherichia coli uropathog ne, Yersinia spp., Helicobacter pylori) ont tendance tre supprim es des fr quences lev es ou peuvent subir des duplications et des amplifications.
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