Le virus de l'immunod ficience humaine de type 1 (VIH-1) mute rapidement sous les pressions de s lection de l'immunit de l'h te, ce qui permet l'amplification de mutations d' chappement qui permettent au virus d' chapper la r ponse immunitaire de l'h te. Les premi res s quences tra ables du VIH-1 de sous-type A (dans le r f rentiel de s quences) taient d'origine africaine et datent du milieu des ann es 80. Dans les ann es qui ont suivi, alors que les virus de sous-type A se propageaient dans le monde entier, des s quences provenant de diff rentes parties du monde ont galement commenc appara tre. Au cours des derni res d cennies, le VIH-1 de sous-type A s'est implant dans certaines r gions du monde, notamment au Kenya, en Ouganda, au Japon, en Azerba djan, en Belgique, au Botswana, en Bi lorussie, au Congo et, plus r cemment, en Afghanistan et au Pakistan. L'analyse des sch mas volutifs d'un virus dans le contexte de ses populations h tes met en lumi re les pressions de s lection exerc es sur les virus qui sont associ es des milieux immunitaires h tes sp cifiques. Ce type d'information est utile pour la conception de vaccins et de m dicaments contre le virus.
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