Die Sequenzausrichtung ist n tzlich, um funktionelle, strukturelle und evolution re Informationen in biologischen Sequenzen zu entdecken, wobei es wichtig ist, die bestm gliche oder so genannte optimale Ausrichtung zu erhalten, um diese Informationen zu entdecken. Wenn sich zwei Sequenzen aus verschiedenen Organismen hneln, kann es sein, dass sie eine gemeinsame Vorg ngersequenz waren, und die Sequenzen werden als homolog definiert. Sobald die MSA gefunden wurde, kann die Anzahl der Arten von nderungen in den ausgerichteten Sequenzresten f r eine phylogenetische Analyse verwendet werden. In einigen F llen ist die Position so wichtig f r die Funktion, dass Mutations nderungen nicht beobachtet werden.
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