Naegleria fowleri, l'"amibe mangeuse de cerveau", est l'origine de la m ningo-enc phalite amibienne primaire (MAM), une maladie mortelle. Dans cette tude, des chantillons de LCR provenant de 80 patients suspect s de m ningo-enc phalite amibienne primaire ont t analys s pour des indicateurs cl s tels que la num ration des leucocytes, le glucose, les prot ines et la microscopie. Si 79 chantillons se sont r v l s n gatifs, un a t confirm positif pour N. fowleri par PCR et microscopie. De mani re surprenante, les tests courants du LCR (prot ines lev es, glucose faible, TLC lev ) n'ont pas permis de distinguer la PAM d'autres types de m ningite, soulignant la n cessit de la PCR et de la microscopie humide pour un diagnostic pr cis. L' chantillon positif a t cultiv sur une g lose non nutritive (NNA) et le s quen age mitochondrial a permis d'identifier N. fowleri. Le g notypage a r v l le g notype 2 de N. fowleri, ce qui constitue le premier rapport au Pakistan. La surveillance environnementale des r serves d'eau de Karachi a permis d'identifier N. fowleri dans 11 endroits, y compris au domicile du patient, tablissant ainsi un lien entre l'eau contamin e et l'infection. Depuis 2011, tous les cas de PAM Karachi ont t rapport s ici. Cette tude fournit des donn es g notypiques essentielles et plaide en faveur d'une meilleure surveillance de la qualit de l'eau, de la sensibilisation du public et de l'am lioration des infrastructures pour lutter contre cette malad
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