Dans ma th?se de doctorat, j'ai d?crit une RT-PCR ? grande ?chelle et un pipeline de clonage que j'ai d?velopp? pour obtenir plusieurs milliers de clones d'ADNc de mammif?res (principalement des humains et des souris) pour l'effort de collecte de g?nes de mammif?res du NHGRI/NCI. ? cette ?poque, les couches de la complexit? du transcriptome des mammif?res n'?taient pas encore enti?rement con?ues. Dans ce projet, j'ai ?t? profond?ment impliqu? dans les questions strat?giques et conceptuelles de la caract?risation de la complexit? du transcriptome ? diff?rents niveaux. En utilisant le pipeline RT-PCR combin? ? des algorithmes de pr?diction des g?nes qui utilisent des informations g?nomiques comparatives, nous avons r?ussi ? identifier et ? v?rifier exp?rimentalement de nouveaux g?nes de mammif?res tels que des homologues de rats entiers de g?nes de maladies humaines. En outre, j'ai ?tudi? la complexit? des transcriptomes, y compris les SNP et l'?pissage alternatif dans des ?chantillons de leuc?mie en utilisant la PCR quantitative, et nous avons d?velopp? une technologie d'analyse de traces pour identifier plusieurs transcrits ?piss?s alternatifs en une seule r?action de s?quen?age. Mes r?sultats sugg?rent que les transcriptions ?pissur?es alternativement pr?sentent une r?gulation ascendante ou descendante sp?cifique au type de cancer, et que le rapport des isoformes ?pissur?es alternativement peut ?tre ? la base du m?canisme du cancer.
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