Assemblierung und Fertigstellung prokaryotischer Genome mit optischer Kartierung [German]

By Diego C B Mariano, Rommel T J Ramos, Vasco A C Azevedo

Die st ndige Verbesserung der DNA-Sequenzierungsplattformen hat dazu gef hrt, dass die Zeit f r das Lesen und Identifizieren von Genomen immer weiter verk rzt und die Kosten immer weiter gesenkt werden konnten. Allerdings weisen Sequenzierer noch immer Einschr nkungen auf, beispielsweise hinsichtlich der Gr e der DNA-Fragmente, die sie identifizieren k nnen. Daher wird die DNA vor der Sequenzierung fragmentiert und nach diesem Schritt so neu angeordnet, dass sie das urspr ngliche Genom repr sentieren kann. Dieser als Genom-Assemblierung bezeichnete Prozess erfordert den Einsatz verschiedener In-vitro- und In-silico-Strategien. In den letzten Jahren wurden verschiedene Strategien zur Genom-Assemblierung vorgeschlagen, jedoch besteht noch kein Konsens dar ber, welcher Ansatz der beste ist. In j ngster Zeit wurden mehrere Genome mithilfe einer Technik fertiggestellt, die als optisches Kartieren des gesamten Genoms (WGM) bekannt ist. Diese Technik erm glicht hochwertige Assemblierungen auf der Grundlage einer hochpr zisen Restriktionskarte. Die Restriktionskarte erm glicht es, Contigs ohne Referenzgenom zu orientieren und zu ordnen. Die optische Kartierung wird eine neue ra schnellerer, kosteng nstigerer und immer pr ziserer Genomassemblierungen einl uten.

• Format: Paperback
• Language: German
• ISBN: 6209107001
• ISBN13: 9786209107009
• Release Date: October 2025
• Publisher: Verlag Unser Wissen
• Length: 60 Pages
• Weight: 0.21 lbs.
• Dimensions: 0.1" x 6.0" x 9.0"